Personalis publie de nouvelles données prouvant la capacité d’un algorithme hautement sensible à détecter la perte d’hétérozygotie du gène HLA
13 4월 2022 - 7:55AM
Business Wire
L’outil détecte un
biomarqueur de plus en plus important en matière
d’immunothérapie
Personalis, Inc. (Nasdaq : PSNL), chef de file de la génomique
avancée pour l’oncologie de précision, a annoncé aujourd’hui la
publication de son étude intitulée « Un algorithme d’apprentissage
automatique avec sensibilité sous-clonale révèle une perte étendue
d’hétérozygotie de l’antigène leucocytaire humain pancancer », dans
la revue Nature Communications.
La perte d’hétérozygotie de l’antigène leucocytaire humain (HLA
LOH) permet aux cellules cancéreuses d’échapper à la reconnaissance
immunitaire en supprimant les allèles HLA, provoquant la
suppression de la présentation des néo-antigènes tumoraux. Malgré
son importance dans le cadre de la réponse à l’immunothérapie, peu
de méthodes existent pour détecter la HLA LOH, et leur précision
n’est pas bien comprise. En outre, la détection précise de la HLA
LOH à partir de données de séquençage présente un intérêt, compte
tenu de la généralisation croissante du profilage moléculaire des
tumeurs.
L’étude de Personalis fournit des renseignements sur le
développement de la Suppression des HLA spécifiques aux allèles
(Deletion of Allele-Specific HLAs, DASH), algorithme novateur basé
sur l’apprentissage automatique, qui permet de détecter la HLA LOH
à partir de données de séquençage tumeur-normal en paires. Grâce à
la validation avec des mélanges de lignées cellulaires et des PCR
numériques spécifiques au patient, l’étude révèle une sensibilité
accrue de la détection de la HLA LOH grâce à DASH, par rapport aux
outils précédemment publiés, et ouvre la voie à une utilisation
clinique. Utilisant DASH pour 610 patients présentant 15 types de
tumeurs différents, l’étude a constaté qu’un large pourcentage de
patients étaient impactés par la HLA LOH, notamment des patients
présentant un cancer bronchopulmonaire non à petites cellules à
adénocarcinome (CBNPC-A) (24 %), un cancer cervical (38 %), ou un
carcinome épidermoïde de la tête et du cou (CETEC) (40 %). En
outre, l’étude a révélé des taux élevés de HLA LOH par rapport à la
LOH à l’échelle du génome, ainsi que des corrélations entre
l’expression du gène CD274 (PD-L1) et le statut d’instabilité
microsatellitaire, ce qui suggère que la HLA LOH constitue une
stratégie clé de résistance immunitaire.
« La détection précise de la HLA LOH est essentielle dans le
cadre de son utilisation en tant que biomarqueur pour
l’immunothérapie contre le cancer. Cette étude démontre la capacité
de DASH à détecter de manière sensible les événements sous-clonaux
dans des échantillons présentant une faible pureté tumorale, ce qui
permet de réaliser un profilage complet de la HLA LOH étendue sur
tous les types de tumeurs », a déclaré le Dr Richard Chen, chef du
service médical et vice-président principal de la R&D, chez
Personalis. « Intégrés à la NeXT Platform de Personalis, ces
événements de HLA LOH identifiés par DASH constituent une
contribution essentielle, qui permet à notre biomarqueur composite
multiomique, NEOPS™, de mieux prédire la réponse à
l’immunothérapie. »
À propos de Personalis
Personalis, Inc. est un chef de file de la génomique avancée du
cancer, visant à permettre la prochaine génération de thérapies et
de diagnostics anticancéreux de précision. La Personalis NeXT
Platform® est conçue pour s’adapter aux connaissances complexes et
en constante évolution sur le cancer, en fournissant à ses clients
et aux cliniciens du secteur biopharmaceutique, des informations
sur l’ensemble des près de 20 000 gènes humains, ainsi que sur le
système immunitaire, à partir d’un simple échantillon. Pour
permettre le séquençage du cancer, le Clinical Laboratory de
Personalis a été construit en mettant l’accent sur la précision
clinique, la qualité, les mégadonnées, l’échelle et l’efficience.
Le laboratoire est conforme aux normes de bonne pratique ainsi
qu’aux amendements relatifs à l’amélioration des laboratoires
cliniques de 1988, et est accrédité par le College of American
Pathologists. Pour en savoir plus, rendez-vous sur le site Web de
Personalis, et suivez Personalis sur LinkedIn et Twitter.
Déclarations prévisionnelles
Toutes les déclarations de ce communiqué de presse qui ne sont
pas de nature historique sont des « déclarations prévisionnelles »
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notamment les déclarations relatives aux attributs et avantages de
la plateforme ImmunoID NeXT®, de l’algorithme SHERPA® ou du
biomarqueur NEOPS, aux opportunités commerciales, au leadership,
aux plans ou attentes de Personalis, ou à d’autres événements
futurs. Ces déclarations prévisionnelles impliquent des risques et
des incertitudes, qui pourraient entraîner une différence sensible
entre les résultats réels et toutes attentes ou tous résultats
anticipés, exprimés ou sous-entendus dans lesdites déclarations.
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